前期籌備階段

組建團隊與開展培訓：成立由管理者牽頭的認證工作組，明確各部門職責；組織全員學習 GJB9001C 標準，其中內審員需完成專業培訓并取得資格證書，確保核心人員能掌握軍工特色的質量管理要求。

搭建體系并編制文件：結合企業軍工業務，確定質量方針和目標，梳理從研發、生產到交付的全流程，編制質量手冊、程序文件、作業指導書等體系文件，需重點涵蓋技術狀態管理、雙歸零等軍工專屬條款。

體系試運行與內審：讓搭建好的體系試運行至少 3 個月，期間要留存完整的生產記錄、檢驗報告等憑證。試運行后完成 1 次內部審核和管理評審，針對發現的問題整改閉環，同時確保試運行期間有軍品訂單或交付記錄作為業務支撐。

分階段認證審核階段

階段審核：審核組先開展文件評審，核查體系文件是否貼合 GJB9001C 標準，尤其關注軍工條款的落地情況；再進行初步現場走訪，了解企業基本運營狀況，確認是否具備開展第二階段審核的條件，同時可能與軍方用戶座談了解產品相關情況。

第二階段審核：通常在階段問題整改完成后 4 個月內開展，屬于的現場審核。審核組會深入生產車間、保密室等場所，核查涉密管理、關鍵工序控制、產品追溯性等情況，抽查各類記錄憑證，并驗證雙歸零報告等文件的真實性，確認體系運行的有效性。若審核發現問題，會開具一般或嚴重不符合項通知。

質量管理體系相關文件

核心體系文件：包含質量手冊（明確質量方針、組織架構、職責權限等）、程序文件（至少涵蓋設計開發、采購控制等 25 項標準要求的程序文件），以及作業指導書、工藝規程等實操性文件。

體系運行記錄：內部審核報告及對應的整改閉環記錄；管理評審報告及后續改進措施文件；質量目標達成情況統計表，以此證明體系試運行滿 3 個月且運行有效。

整改與發證階段（1 - 4 周）：若審核無不符合項，認證機構內部報批后 1 - 2 周就能發證；若有問題，企業需在 30 天內完成整改并提交佐證材料，審核組驗證整改有效后，機構通常 10 個工作日內批準認證并發證，整改順利的話該階段 2 - 4 周即可結束。