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公司營業(yè)執(zhí)照丟失后，應(yīng)當(dāng)按照以下步驟進行補辦：

一、向原登記機關(guān)申報營業(yè)執(zhí)照掛失

首先，公司需要向原登記機關(guān)（即工商局）申報營業(yè)執(zhí)照的掛失。這是補辦營業(yè)執(zhí)照的步，也是確保公司后續(xù)操作合法性的基礎(chǔ)。

二、法人簽署相關(guān)文件并公司蓋章

法人需要簽署《營業(yè)執(zhí)照遺失、補發(fā)申請報告》，并由公司蓋章。這份報告是向工商局說明營業(yè)執(zhí)照遺失情況，并申請補發(fā)的重要文件。

同時，法人還需要簽署《指定代表人或共同委托代理人授權(quán)委托書》，并由公司蓋章。這份文件是用于指定代表人或共同委托代理人進行后續(xù)補辦手續(xù)的。

三、登報聲明營業(yè)執(zhí)照遺失

公司需要在市級以上的報紙上刊登營業(yè)執(zhí)照遺失聲明。這是為了公示營業(yè)執(zhí)照的遺失情況，防止被他人冒用。

四、領(lǐng)取新證

在完成上述步驟后，公司可以按照工商局的通知，到指定地點領(lǐng)取新的營業(yè)執(zhí)照。新證將領(lǐng)取代替原有的遺失證件，公司應(yīng)妥善保管。

需要注意的是，整個補辦過程需要遵循相關(guān)法律法規(guī)和政策規(guī)定，確保所有手續(xù)的合法性和有效性。同時，公司也應(yīng)加強對營業(yè)執(zhí)照的管理，防止類似事件的再次發(fā)生。