賬簿設置與記賬不規范

未按規定建賬：

小規模納稅人誤以為無需建賬，僅用流水賬代替正規賬簿，不符合《稅收征收管理法》要求，可能被責令限期改正。

會計科目使用混亂：

例：將 “管理費用” 與 “銷售費用” 混淆；股東個人消費計入公司 “差旅費”，導致稅務稽查時被認定為偷稅。

憑證與票據缺失：

無票支出（如向個人采購未取得發票）直接入賬，稅前扣除不合規；報銷憑證無經辦人簽字、無附件清單，導致賬務真實性存疑。

納稅申報錯誤與遺漏

逾期申報或零申報違規：

未在申報期（如每月 15 日前）完成納稅申報，按日加收滯納稅款 0.05% 的滯納金；長期零申報（連續 3 個月以上）可能被稅務機關列為重點監控對象。

稅種申報遺漏：

忽視附加稅（城建稅、教育費附加）申報；未代扣代繳員工工資的個人所得稅（即使工資未達起征點也需申報）。

計稅依據錯誤：

例：增值稅申報時，未區分含稅收入與不含稅收入，多算或少算應納稅額；企業所得稅預繳時，未按實際利潤額申報，導致預繳稅款錯誤。

財務與稅務政策理解偏差

小規模納稅人與一般納稅人政策混淆：

小規模納稅人季度銷售額超 45 萬元（2023 年起政策可能調整）未足額繳納增值稅；一般納稅人錯誤享受小規模免稅政策。

稅收優惠適用錯誤：

未正確判斷企業是否符合小微企業所得稅優惠條件（如資產總額、從業人數、應納稅所得額超標），多享受減免稅。

特殊業務處理失誤

跨區域經營未報驗：

異地開展建筑施工等業務，未辦理《跨區域涉稅事項報告表》，導致無法在經營地預繳稅款，回機構所在地申報時產生滯納金。

注銷前未清算稅務：

公司注銷時未完成稅務清算，存在未繳稅款或未核銷發票，導致無法正常注銷，甚至影響法人信用。