北京兒童醫院技術力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監測中心、國家呼吸系統疾病臨床醫學研究中心、國家中西醫協同旗艦醫院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點專科，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫療中心。醫院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內地位，是中華醫學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫師協會小兒外科醫師分會，中華護理學會兒科專業委員會主任委員單位。

肥胖的原因可以是營養性肥胖，也可以是病理性肥胖。隨著社會經濟水平的發展，肥胖已成為嚴重影響國人健康的重要問題。高熱量食品、久坐的生活方式、工作生活壓力等不健康的生活方式是導致非病理性肥胖的主要原因。

兒童期肥胖帶來的后果不可小視。較多見的并發癥如代謝綜合征、糖尿病、高血壓、高血脂、脂肪肝、痛風、睡眠障礙大血管和微血管疾病以及癌癥等。因此，積極篩查肥胖的病因及相關并發癥并進行有針對性的至關重要。

鞏純秀主要研究方向為兒童糖尿病領域，涵蓋兒童糖尿病流行病學研究、生存、代謝控制狀況及胰島素抵抗相關疾病范化研究。先天性高胰島素性/新生兒糖尿病臨床與遺傳學研究。性腺研究主要包括嬰幼兒乳房發育臨床監測、DSD病因學及Kallmann綜合征的基因學研究、小陰莖的、AAA綜合征的遺傳學研究、DSD患者體格發育研究、Silver Russule 綜合征遺傳學研究等。同時承擔研究生教學以及留學生英文教學。