北京兒童醫院技術力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監測中心、國家呼吸系統疾病臨床醫學研究中心、國家中西醫協同旗艦醫院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點?？?，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫療中心。醫院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內地位，是中華醫學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫師協會小兒外科醫師分會，中華護理學會兒科專業委員會主任委員單位。
北京兒童醫院共有在職職工3210人，其中醫生968人，護士1325人，醫技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫院擁有中國現代兒科學奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學開創者胡亞美、中國小兒外科創始人之一張金哲等國內兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學基金獲得者等眾多高層次人才。
北京兒童醫院醫院內分泌科矮小專業門診根據患兒而且具體情況評估可能的診斷，如對于懷疑生長缺乏癥的，或者低出生體重、家族性矮小癥、特納綜合征等根據情況，選擇運動試驗，必要時住院進行生長激發實驗。同時本亞專業有相應的矮小管理項目，分別進行生活方式干預或者治 療。本亞專業定期發布的臨床試驗和醫院及的研究試驗。
鞏純秀，中華醫學會兒科內分泌遺傳代謝學組副組長，中華醫學會糖尿病學會委員，中華醫學會糖尿病學會1型糖尿病學組副組長，北京醫學會兒科分會內分泌遺傳代謝學組組長，中華醫學會糖尿病學分會北京分會委員，原亞太兒科內分泌學會理事會理事，中國醫師協會內分泌代謝學分會常委。中華兒科雜志編委,中華醫藥雜志常務編委，中華糖尿病雜志編委，中國糖尿病雜志編委，中國實用兒科雜志編委，中國小兒急救醫學編委，免疫分析與臨床雜志編委，柳葉刀糖尿病內分泌中文版編委。
