根據相關法律規定，農民工工資保證金確實可以使用金融機構出具的保函來替代。《保障農民工工資支付條例》第三十二條明確指出，“工資保證金可以用金融機構保函替代”，這意味著除了傳統的現金繳存方式外，還可以通過保函的方式來滿足這一制度的要求。

商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。

如果約定了雙倍返還或具有定金獨特屬性的內容，符合定金法則，則是定金；如果沒有出現"定金"字樣，也沒有明確約定適用定金性質的處罰之類的約定，已經交納的履約保證金，就不是定金，而是其他金錢質。約定了履約保證金卻又沒有交納的，關于履約保證金的約定成立但不發生法律效力（因為，質押合同也是實踐性合同，必須以交付為生效條件）。

履約保函 Performance Guarantee，履約保函是指：應勞務方和承包方（申請人）的請求，銀行金融機構向工程的業主方（受益人）做出的一種履約保證承諾。如果勞務方和承包方日后未能按時、按質、按量完成其所承建的工程，則銀行將向業主方支付一筆約占合約金額5%~10%的款項。履約保函有一定的格式限制，也有一定的條件。