進料加工貿易的進口，其大體的程序差不多。不同的是要先辦手冊。（關于手冊的辦理有空再另辟主題）分為進料加工手冊和來料加工手冊。報關的時候要用加工貿易的手冊，再加上一般貿易幾口所需的資料進行報關。
再就是繳關稅，因為有手冊，所以如果你進口的貨物是免稅的，只繳保證金，有的是需要繳全額的也就是的保證金，有的只繳100元的保證金。這些保證金等你的手冊上面的所有進口料件核出口成品都出完了，那就要核銷，核銷完了你繳的保證金會一分不少的退回給你。和一般貿易所交的關稅的操作程序一樣。只不過一個是關稅，一個是保證金。
1、進口貨物報關單
一般進口貨物應填寫一式二份；需要由海關核銷的貨物，如加工貿易貨物和保稅貨物等，應填寫專用報關單一式三份；貨物出口后需國內退稅的，應另填一份退稅專用報關單。
2、貨物發票
要求份數比報關單少一份，對貨物進口委托國內銷售，結算方式是待貨物銷售后按實銷金額向出口單位結匯的，進口報關時可準予免交。
進口，是指將貨物從外國境外移送至我國境內的行為。稅法規定，凡進入我國海關境內的貨物，應于進口報關時向海關繳納進口環節增值稅。
清關（Customs Clearance）即結關，是指進口貨物、出口貨物和轉運貨物進入或出口一國海關關境或國境必須向海關申報，辦理海關規定的各項手續，履行各項法規規定的義務。
相信很多商家都試過從外直郵快遞化妝品、奶粉、紅酒、食品、保健品、私人物品等回國被海關扣貨，又或者從國外空運到國內機場監管中心，但又取不出。再或者因攜帶多于海關規定的量，而補交關稅的種種情況。
那從國外進口如何避免海關扣貨？從香港中轉進口就可以解決以上所有問題。
此外，進口商應注意貨物的申報期。海關規定，進口貨物應自運輸工具進境之日起l4日內辦理申報。如逾期申報，海關則自第l5日起按到岸價每日征收0．05%的滯報金。如超過3個月仍未申報，海關即變賣貨物，在扣除各種費用后，余款上繳國庫。
