主要是恢復操作系統、文件系統層的數據。這種丟失主要是軟件邏輯故障、病毒木馬、誤操作等造成的數據丟失，物理介質沒有發生實質性的損壞，一般來說這種情況下是可以修復的，一些專用的數據恢復軟件都具備這種能力，如winhex，rstudio等。在所有的軟損壞中，系統服務區出錯屬于比較復雜的，因為即使同一廠家生產的同一型號硬盤，系統服務區也不一定相同，而且廠家一般不會公布自己產品的系統服務區內容和讀取的指令代碼。

數據庫系統或封閉系統恢復：

這部分系統往往自身就非常復雜，有自己的一套完整的保護措施，一般的數據問題都可以靠自身冗余保證數據。如SQL、Oracle、Sybase等大型數據庫系統，以及MAC、嵌入式系統、手持終端系統，儀器儀表等系統往往恢復都有較大的難度。

硬件故障數據恢復

硬件故障占所有數據意外故障一半以上，常有雷擊、高壓、高溫等造成的電路故障，高溫、振動碰撞等造成的機械故障，高溫、振動碰撞、存儲介質老化造成的物理壞磁道扇區故障，當然還有意外丟失損壞的固件BIOS信息等。

硬件故障的數據恢復當然是先診斷，對癥下藥，先修復相應的硬件故障，然后根據修復其他軟故障，終將數據成功恢復。

電路故障需要我們有電路基礎,需要更加深入了解硬盤詳細工作原理流程。機械磁頭故障需要100級以上的工作臺或工作間來進行診斷修復工作。另外還需要一些軟硬件維修工具配合來修復固件區等故障類型。