在體系運行期間，為審查組織的環境管理活動是否已按環境管理體系文件的規定進行，環境管理體系是否得到了正確的實施和保持，為確定體系的持續適用性、充分性、有效性，組織應組織內部審核和管理評審。
貫穿這些工作始終的另一項重要工作是全員培訓。建立和實施環境管理體系強調全員參與。建立和實施環境管理體系的任何一個環節，都有賴于全體人員共同努力，任何一個員工都不可能游離于體系之外，為使他們都能理解并以實際行動支持體系的建立和運行，組織必須進行充分的培訓，內容從ISO14001標準，到環境方針，到適用法律法規，到個人職責，到重要環境因素，到體系文件，到作業指導書，到運行記錄……
ISO 14000系列標準歸根結底是一套管理性質的標準。它是工業發達國家環境管理經驗的結晶，在制定國家標準時又考慮了不同國家的情況，盡量使標準能普遍適用。
·ISO 14001標準對企業的積極影響主要體現在以下幾個方面：
·樹立企業形象，提高企業的知名度
·促使企業自覺遵守環境法律、法規
·促使企業在其生產、經營、服務及其他活動中考慮其對環境的影響，減少環境負荷
ISO/TS16949:2009是國際汽車行業的技術規范，是基于ISO9001的基礎，加進了汽車行業的技術規范。此規范完全和ISO9000:2008保持一致，但更著重于缺陷防范、減少在汽車零部件供應鏈中容易產生的質量波動和浪費。ISO/TS16949標準的針對性和適用性非常明確，只適用于汽車整車廠和其直接的零備件制造商，也就是說這些廠家必須是直接與生產汽車有關的，能開展加工制造活動，并通過這種活動使產品能夠增值。同時，對所認證公司廠家的資格也有著嚴格的限定，那些只具備支持功能的單位，如設計中心，公司總部和配送中心等，或者那些為整車廠家或汽車零備件廠家制造設備和工具的廠家，都不能獲得認證。對ISO/TS16949:2009認證的管理是由5大監督機構代表IATF來完成的，它們采用相同的程序方法來監督ISO/TS16949規范的操作和實施，以在全世界形成一個標準和操作完全統一的系統。
在現代貿易實踐中，第二方審核早就成為慣例，又逐漸發現其存在很大的弊端：一個組織通常要為許多顧客供貨，第二方審核無疑會給組織帶來沉重的負擔；另一方面，顧客也需支付相當的費用，同時還要考慮派出或雇傭人員的經驗和水平問題，否則，花了費用也達不到預期的目的。唯有ISO9001認證可以排除這樣的弊端。因為作為方申請了第三方的ISO9001認證并獲得了認證證書以后，眾多第二方就不必要再對方進行審核，這樣，不管是對方還是對第二方都可以節省很多精力或費用。還有，如果企業在獲得了ISO9001認證之后，再申請UL、CE等產品品質認證，還可以免除認證機構對企業的質量管理體系進行重復認證的開支。
