空氣凈化呼吸器的外層往往積聚著很多外界空氣中的灰塵、等污物，而里層阻擋著呼出的、唾液，因此，兩面不能交替使用，否則會將外層沾染的污物在直接緊貼面部時吸入人體，而成為傳染源。口罩在不戴時，應疊好放入清潔的信封內，并將緊貼口鼻的一面向里折好，切忌隨便塞進口袋里或是在脖子上掛著。

若空氣凈化呼吸器被呼出的熱氣或唾液弄濕，其阻隔病菌的作用就會大大降低。所以，平時多備幾只口罩，以便替換使用，應每日換洗一次。洗滌時應先用開水燙5分鐘。

空氣凈化呼吸器應該堅持每天清洗和，不論是紗布口罩還是空氣過濾面罩都可以用加熱的辦法進行。具體做法是：

1.清洗。先用溫水和肥皂輕輕地揉搓紗布口罩，碗形面罩可以用軟刷蘸洗滌劑輕輕刷凈，然后用清水洗干凈。請注意，千萬不要用力揉搓，因為如果紗布的經緯間隙過大就失去了防阻飛沫的作用。

2.。將洗干凈的口罩放在2%的過氧乙酸溶液中浸泡30分鐘或在開水里煮20分鐘或放在蒸鍋里蒸15分鐘，然后晾干備用。這種方法適用于紗布口罩和碗形面罩。

3.檢查。再次使用前，應該仔細檢查口罩和面罩是否仍然完好，對于紗布口罩和面罩都可以采取透光檢查法，即拿到燈前照看，看看有沒有明顯的光點，中間部分與邊緣部分透光率是不是一致，如果有疑問就要更換新的。不論怎樣，面罩和口罩在清洗3至7次以后一般就要更新，質量特別好的口罩可以清洗10次。活性炭吸附式口罩要注意定期更換活性炭夾層，如果活性炭夾層是不可更換的，用過7至14天就要更換，這種口罩是不能清洗后再重復使用的。