預付款保函和履約保函是兩種不同類型的保證函，它們之間存在明顯的區別。

一、保證責任

預付款保函和履約保函的保證責任不同。預付款保函主要是由保證人為施工方向業主提供的，保證人對施工方履行扣還預付款義務的保證。這意味著，如果施工方未能按照約定扣還預付款，保證人將承擔相應的保證責任。而履約保函則是由擔保人為施工方向業主提供的，保證施工方能夠按照合同規定履行其義務。如果施工方未能履行合同義務，擔保人將承擔相應的擔保責任。

二、擔保時間

預付款保函和履約保函的擔保時間也有所不同。預付款保函的擔保時間通常較短，一般為30-90天。這是因為預付款保函主要是為了保證施工方能夠按照約定扣還預付款，而這個過程通常不會太長。相比之下，履約保函的擔保時間往往要貫穿整個項目，時間比較長。這是因為履約保函是為了保證施工方在整個項目期間都能履行合同義務。

綜上所述，預付款保函和履約保函在保證責任和擔保時間方面存在明顯的區別。因此，在選擇使用哪種保證函時，應根據具體情況和需求進行考慮。