北京大學腫瘤醫院肝膽胰外一科創建于1996年。現有病床33張，醫師10人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱1人，中級職稱4人，在讀研究生4人，所有醫生均為研究生畢業。建科以來，在黃信孚及邢寶才主任的領導下，科室全體醫師秉承以"延長病人生存，改善病人生活質量，為病人解除病痛"為目標，把肝膽胰腫瘤綜合的理念與肝膽胰外科手術的近技術相結合，不斷創新，不斷提高，不斷完善，形成了鮮明的本科室的診療特色。在醫療、科研和教學方面居國內水平。同時，培養出了一大批研究生和青年醫師。

現任主任邢寶才，教授，主任醫師。擔任：中國協會肝癌專業委員會常委，中華外科學會肝臟外科學組委員，中華腫瘤學會肝癌學組委員，中國協會大腸癌肝轉移學組委員，中國協會膽道腫瘤委員會常委，中國協會胰腺癌委員會委員，衛生部腫瘤規范化專家委員會委員，北京協會理事，北京協會肝膽胰腫瘤委員會主任委員，北京腫瘤學會委員，北京大學肝癌中心副主任，北方肝癌專家委員會副主任。同時擔任多種雜志的編委和審稿專家。

乳腺癌預防中心提供乳腺腫瘤診斷及方面的醫療服務。本中心于1998年在北京市重點學科專項資助下組建。2004年結構調整，成為具備乳腺腫瘤診治功能的一級臨床科室，功能涵蓋乳腺癌篩查，乳腺病變的診斷，原發性乳腺癌、隨訪及康復指導，復發性乳腺癌，同時開展相關臨床與基礎研究。

2021年科室醫生總人數30人，正高職稱人數6人，副高職稱人數8人，中級職稱人數13人，初級師人數3人。按學歷劃分：博士21人，碩士4人，本科4人，專科1人。科室主任：歐陽濤，副主任：范照青、何英劍。護士長：于新穎、徐京燕、孫紅娟。

本中心由門診診室4間、住院床位64張、門診穿刺室、超聲影像診斷室等部分組成。

“依據循證醫學原則，結合研究成果，提供規范的、專業化的醫療服務，保障乳腺腫瘤的總體療效”是“中心”的任務，“提供高品質的醫療服務，做出有指導意義的研究成果”是“中心”團隊追求的目標。

北京大學腫瘤醫院黑色素瘤與肉瘤內科，始建于2005年，通過十余年的快速發展，科室具有強大的醫療科研團隊，開設本院、南院共兩個病區，以及臨床轉化實驗室。年門診量30000余人次，收治患者8000余人次。全科在編醫生10名，研究人員2名, 合同醫生1名，在編均為博士學位,其中主任醫師4名，副主任醫師4名，研究員1名，副研究員1名。學科帶頭人郭軍主任，任Melanoma World Society (MWS) 副主席及中國臨床腫瘤學會(CSCO)副理事長兼秘書長等職務。科室多人數次獲得，市級人才培養計劃。近年留學回國青年醫師7人，與多家國際黑色素中心建立良好合作。

北京大學腫瘤醫院放療科始建于1976年，同年，我國臺直線加速器在這里自主研制成功。

放療科2000年即在國內較早開始開展三維立體定向適形放療， 2004年在北京市率先開展三維適形動態調強放射，迄今采用調強放療技術患者超過13000例，并取得良好的療效。2008年放療科引進了具有功能的后裝機、大孔徑CT定位機和20套先進的計劃系統， 2009年國內臺VMAT在我放療投入使用;2011年國內臺True Beam投入使用;2012年引進國內首套大孔徑核磁定位系統放射，在放療設備的配置方面達到了國際先進水平。